Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prkrip1Q9CWV6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms