Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdca4Q9CWM2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms