Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms