Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Q9CRC3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Q9CRC3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CRC3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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