Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9CR55 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CR55 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CR55 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CR55 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CR55 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CR55 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CR55 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CR55 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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