Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NmbQ9CR53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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