Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpb2Q9CQI7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms