Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms