Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Chchd1Q9CQA6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Chchd1Q9CQA6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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