Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc5Q9CQA1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms