Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp3Q9CQ10 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chmp3Q9CQ10 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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