Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ska1Q9CPV1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms