Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPN7

1810009J06Rik, RIKEN cDNA 1810009J06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810009J06RikQ9CPN7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1810009J06RikQ9CPN7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
1810009J06RikQ9CPN7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms