Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gtf2a1Q99PM3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf2a1Q99PM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms