Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Smim3Q99PE5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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