Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp1b1Q99LU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp1b1Q99LU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms