Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clp1Q99LI9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clp1Q99LI9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms