Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl22Q99JN2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl22Q99JN2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms