Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ddb2Q99J79 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms