Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms