Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ripply3Q924S9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ripply3Q924S9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripply3Q924S9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripply3Q924S9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripply3Q924S9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ripply3Q924S9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms