Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Letmd1Q924L1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Letmd1Q924L1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms