Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tubb6Q922F4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb6Q922F4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms