Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh3bp4Q921I6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh3bp4Q921I6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms