Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TardbpQ921F2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TardbpQ921F2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms