Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Odf3Q920N1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Odf3Q920N1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms