Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx4Q91YJ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx4Q91YJ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms