Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam20bQ8VCS3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam20bQ8VCS3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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