Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC6

Ccm2l, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2lQ8VCC6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccm2lQ8VCC6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2lQ8VCC6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms