Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RorbQ8R1B8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RorbQ8R1B8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms