Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Vrk3Q8K3G5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Vrk3Q8K3G5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vrk3Q8K3G5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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