Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Lrrtm1Q8K377 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Lrrtm1Q8K377 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrtm1Q8K377 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrtm1Q8K377 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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