Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otud6bQ8K2H2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otud6bQ8K2H2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms