Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne5Q8JZW4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne5Q8JZW4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms