Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rasgef1bQ8JZL7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms