Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mterf1aQ8CHZ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms