Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rp1l1Q8CGM2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms