Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx8Q8CFD4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx8Q8CFD4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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