Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp27Q8CEG8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Usp27Q8CEG8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18■□□□□ 0.47
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Usp27Q8CEG8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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