Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc17Q8CE13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms