Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc87Q8CDL9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms