Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cacnb2Q8CC27 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cacnb2Q8CC27 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms