Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf170Q8CBG9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms