Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nrip1Q8CBD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nrip1Q8CBD1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms