Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Usp20Q8C6M1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp20Q8C6M1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Usp20Q8C6M1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp20Q8C6M1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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