Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms