Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms