Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms