Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms