Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf18Q8BM39 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf18Q8BM39 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms